Das integrale, also „wiederherstellende“ Projekt Wertach Vital wurde 1997 ebenfalls durch das Wasserwirtschaftsamt Donauwörth initiiert. Auch dieses Projekt lief integrativ ab und gab allen Akteuren, also auch den Bürgern und Bürgerinnen die Chance auf Mitbeteiligung im offenen und ganzheitlichen Konzept. Flussmorphologische und ökologische Aspekte spielten dabei ebenso eine Rolle wie Überlegungen zum Hochwasserschutz, bzw. zu Freizeit und Erholung.

Im Jahr 2009 waren die Arbeiten weitgehend vollendet. Der Hochwasserschutz für ein hundertjähriges Ereignis wurde erreicht und die Eintiefung des Flusses wurde gestoppt.
Der Fluss hat sein festes Korsett abgelegt und kann , nicht nur das nötige Geschiebe aus zugelassener Seitenerosion selbst in das Flussbett schaffen, sondern kann nun auch freier pendeln. Wertvolle Lebensräume sind wieder entstanden und bieten Tieren und Pflanzen die nötigen Bedingungen und den Platz zum Ansiedeln. Untersuchungen bestätigen, dass sich die Situation für Lebensgemeinschaften im und am Wasser deutlich verbessert hat. Die im Flussbett eingebrachten Bäume stellen wahre „Fischparadiese“ dar. Auch Menschen erhielten durch weiche Ufer neue Freizeiträume, welche sehr gut und dankbar angenommen werden.